生物信息学 本书特色

本书力求人各个重要的角度反映生物信息学今天的面貌：比较全面地介绍了生物信息学的若干个主要分支，并特别介绍了与人类基因组研究相关的生物信息学的一些较新的成果；着重介绍了数据库和数据库的查询、序列的同源比较及其在生物进化研究中的应用；以生物芯片中的生物信息学问题为例，介绍与基因表达相关的生物信息学问题；还介绍了蛋白质结构研究中的生物信息学问题，以及与分子设计和药物设计相关的生物信息学技术。

生物信息学 内容简介

书分为两部分：一、生物信息学。主要介绍计算生物学与基因组研究，生物信息的数据库，生物和进化树等。二、生物信息学相关话题；dna序列及基因表达语中的信息问题，蛋白质组研究中的信息问题等

生物信息学 目录

丛书序ⅰ
丛书序ⅱ
前言
**章生物信息学：导论
　一、什么是生物信息学？
　二、生物信息学的研究现状与发展趋势
　三、生物信息学的生物学内涵
　　（一）基因与基因组的信息学
　　（二）基因表达的信息学：大规模基因功能表达谱的分析
　　（三）生物大分子的三维结构信息：蛋白质结构模拟与分子设计
　　（四）代谢和疾病发生途径的信息
　四、生物信息学的信息学内涵
　　（一）生物信息数据库
　　（二）分析工具的发展
　五、生物信息学的应用与发展研究
　　（一）与疾病相关的基因信息及相关算法和软件开发
　　（二）建立与动、植物良种繁育相关的基因组数据库，发展分子标记辅助育种技术
　　（三）研究与发展药物设计软件和基于生物信息的分子生物学技术
　六、生物信息学研究和发展中的交叉学科和大科学特点
　　（一）实验生物学家和计算生物学家
　　（二）三种科学文化的融合
　　（三）跨越整个生命科学的大科学
第二章分子生物信息数据库
　一、分子生物信息数据库简介
　　（一）基因组计划和数据库
　　（二）分子生物信息数据库种类
　二、基因组数据库
　　（一）gdb
　　（二）acedb
　三、序列数据库
　　（一）核酸序列数据库
　　（二）embl和genbank数据库格式
　　（三）常用蛋白质序列数据库
　　（四）其他蛋白质序列数据库
　四、结构数据库
　　（一）蛋白质结构数据库pdb
　　（二）蛋白质结构分类数据库scop和cath
　五、二次数据库
　　（一）基因组信息二次数据库
　　（二）蛋白质序列二次数据库
　　（三）蛋白质结构二次数据库
第三章数据库查询和数据库搜索
　一、简介
　二、数据库查询系统entrez
　　（一）entrez系统使用方法
　　（二）entrez系统的特点
　三、数据库查询系统srs
　　（一）srs系统使用方法
　　（二）srs系统的特点
　四、数据库搜索简介
　　（一）核苷酸碱基和氨基酸残基代码表
　　（二）相似性和同源性
　　（三）局部相似性和整体相似性
　　（四）相似性计分矩阵
　五、数据库搜索工具blast
　　（一）程序简介
　　（二）blast程序运行实例
第四章序列的同源比较及分子系统学和分子进化分析
　一、简介
　二、相似序列的获得
　　（一）blast
　　（二）与blast相关的一些知识
　　（三）获得同源序列的其他方法
　三、多序列比对
　四、系统发育分析
　　（一）系统树的构建方法
　　（二）常用的系统树构建程序
　　（三）一些需要注意的问题
　　（四）cog数据库
　五、其他分子标记在生物系统学中的应用
　　（一）rflp（restrictionfragmentlengthpolymorphism）标记
　　（二）pcr扩增片段长度的多样性
　　（三）snp标记
　　（四）同工酶
第五章生物信息学与基因芯片
　一、概述
　　（一）基因芯片简介
　　（二）基因芯片对于生物分子信息检测的作用和意义
　　（三）基因芯片研究和应用中所涉及到的生物信息学问题
　一、基因芯片设计及优化
　　（一）基因芯片设计的一般性原则
　　（二）dna变异检测型芯片与基因表达型芯片的设计
　　（三）cdna芯片与寡核苷酸芯片的设计
　　（四）寡核苷酸探针的优化设计
　　（五）基因芯片的优化
　二、基于芯片的序列分析
　　（一）测定未知序列
　　（二）直接检测目标序列
　　（三）dna序列突变检测分析
　　（四）snp分析
　四、基于芯片的基因功能分析
　　（一）基因表达分析
　　（二）高密度基因表达芯片
　　（三）基因表达图谱
　　（四）寻找基因功能
　五、基因芯片检测结果的分析
　　（一）荧光检测图像处理

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