异位发酵床微生物组多样性 本书特色
本书针对异位发酵床处理猪粪过程微生物组变化进行研究,全书共分5章,分别阐述了微生物发酵床概述、发酵床微生物宏基因组研究方法、异位发酵床微生物宏基因组分析、异位发酵床细菌微生物组多样性以及异位发酵床真菌微生物组多样性。另外,书后提供了真菌分类纲要和细菌分类纲要。
本书可供从事有机污染物微生物治理及其废弃物循环利用及相关领域的科研人员、企业技术人员和管理人员参考,也可供高等学校环境科学与工程、生态学及相关专业师生参阅。
异位发酵床微生物组多样性 内容简介
本书针对异位发酵床处理猪粪过程微生物组变化进行研究,全书共分5章,分别阐述了微生物发酵床概述、发酵床微生物宏基因组研究方法、异位发酵床微生物宏基因组分析、异位发酵床细菌微生物组多样性以及异位发酵床真菌微生物组多样性。另外,书后提供了真菌分类纲要和细菌分类纲要。
本书可供从事有机污染物微生物治理及其废弃物循环利用及相关领域的科研人员、企业技术人员和管理人员参考,也可供高等学校环境科学与工程、生态学及相关专业师生参阅。
异位发酵床微生物组多样性 目录
**章 概述 / 1
**节 微生物发酵床研究进展
1
一、微生物发酵床养猪技术起源 1
二、微生物发酵床养猪技术原理
2
三、微生物发酵床的管理
2
四、发酵床微生物特性研究
3
五、微生物发酵床垫料的资源化利用技术 6
第二节 基于宏基因组技术分析微生物组研究进展 7
一、微生物宏基因组技术发展与应用 7
二、细菌群落宏基因组研究进展 10
三、真菌群落宏基因组研究进展 21
第三节 异位发酵床的原理与结构 32
一、异位发酵床原理与处理工艺 32
二、异位微生物发酵床结构设计 33
三、异位微生物发酵床运行管理 35
四、讨论
36
第二章 发酵床微生物宏基因组研究方法 / 39
**节 概述
39
一、发酵床的原理与优势
39
二、发酵床微生物群落研究进展 39
三、基于宏基因组技术分析微生物组研究 40
第二节 基于宏基因组技术分析发酵床微生物组研究方法 40
一、发酵床垫料样本采集及垫料理化性质测定 40
二、发酵床垫料的发酵程度等级划分
41
三、宏基因组高通量测序
41
四、宏基因组测序数据质控
41
五、分类操作单元(OTUs)聚类分析 41
六、分类操作单元(OTUs)抽平处理 41
七、核心微生物组(core microbiome)分析 41
八、物种分类和丰度分析
42
九、样本复杂度分析
42
十、显著性差异分析
42
第三节 发酵床微生物高通量测序与统计工作流程 43
一、微生物组高通量测序
43
二、短序列去杂
44
第四节 微生物发酵床细菌分类操作单元（OTU）分析 45
一、发酵床细菌分类操作单元(OTU)提取 45
二、发酵床细菌分类操作单元(OTU)比对 45
三、发酵床细菌分类操作单元(OTU)抽平处理 46
四、发酵床细菌分类操作单元(OTU)稀释曲线 46
五、发酵床细菌分类操作单元(OTU)群落α-多样性 48
六、发酵床部分样本微生物(OTUs)物种谱系演化 49
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异位发酵床微生物组多样性 作者简介
刘波，福建省农科院农业生物资源研究所院长，研究员，教授，1987年获福建农大博士学位，1992-1994年德国波恩大学博士后， 1994-1995年美国密执根大学访问学者，1996-2002年德国波恩大学每年1-3个月短期合作研究访问学者，2002年至今被聘为德国波恩大学植物病理研究博士生第二导师，招收德国波恩大学的博士生3名，现任福建省农科院副院长，二级研究员，兼任中国农学会高新技术农业应用专业委员会副理事长，福建省科协常委，福建省农学会副会长，福建省专家协会常务理事，福建省生物化学及分子生物学学会副理事长，福建省昆虫学会理事长，《中国农业科学》、《农业环境科学学报》、《中国生物防治》、《福建农业学报》等编委，德国波恩大学植物病理研究所第二博士生导师，浙江大学生物技术研究所博士生第二导师，福建农林大学研究生导师，福建省农业科学院微生物创新团队和中德生防合作研究项目中方专家。
